Helena Fernandes é coordenadora do Curso de Reabilitação em Medicina do Exercício e Desporto da Faculdade de Medicina da Universidade do Porto (FMUP) desde 2018.
Licenciada em Medicina pelo ICBAS, com mestrado em Medicina Desportiva pela FMUP, é especialista em Medicina Física e de Reabilitação (Assistente Hospitalar Graduada) e especialista em Medicina Desportiva, tendo colaborado com a Federação Portuguesa de Atletismo e o Futebol Clube do Porto, a Autoridade Antidopagem de Portugal (ADOP) e a Union des Associations Européennes de Football (UEFA).
Pertence, atualmente, ao corpo clínico do Centro de Medicina e Traumatologia Desportiva CUF Porto e é responsável pela consulta de Lesões do Desportista do Instituto CUF Porto.